廣州市花都區供銷合作社聯合社主要職能包括：

1.宣傳和貫徹執行黨中央國務院和省、市農村經濟工作和社會發展的方針、政策，制定全區供銷合作社發展規劃，指導供銷合作社的改革和發展。

2.負責全區再生資源回收開發利用管理，承擔再生資源回收利用網絡體系建設，配合有關部門打擊和查處再生資源經營中的違法違規行為。

3.承擔政府委托的任務，負責農村現代流通服務網絡體系建設和規范經營、規范管理工作。興辦適合農民和社區居民特點的現代流通服務網絡，為農民和社區居民提供綜合服務。參與和推進農業產業化經營，組織引導農民興辦各類專業合作社、農產品行業協會，搞活農副產品流通。

4.按照區政府授權或要求，做好重要農業生產資料及“三防”物資的組織、儲備和供應工作；根據生產情況，做好大宗農副產品經營、組織協調工作。

5.指導全區供銷合作社管理體制和經濟體制改革，協調有關部門關系，維護供銷合作社的合法權益。

6.行使本級社有資產出資人職能，負責社有資產監督管理和運營，促進保值增值。

7.參與國家和省、市供銷合作社系統組織的有關活動。組織本系統對外和對內經濟貿易、技術、人才交流，促進供銷合作社經濟發展。

8.承辦區政府和上級供銷合作總社交辦的其他事項。